化工原料药企业要发展，环境也要得到保护。这对矛盾的解决，绝不仅仅只限于排污治理这样狭窄的范畴，尤其是在中国区域贫富差异明显存在的情况下，更多的时候取决于环境成本和经济效益之间的权衡：后者是否足以大到补偿前者且有余，前者是否会进入一种不可扭转的生态破坏。  
 
　　 但并不是大多数人都赞同 “ 为了环境保护，宁可放慢医药经济的发展速度 ” ，这其中不仅仅涉及医药企业这样的直接利益方，还有一个特征：收入越低的人越不赞同，原因在于这样的取舍往往意味着原料药企业的向外迁移，进而导致更低的就业率、更多的直接经济利益受损等等。

　　我们需要找到处理环境问题的合适的政策工具，从而督促医药企业这样的市场主体在发展自身的同时，承担起合理的环境成本。发达国家在这方面所采取的方案通常有庇古税、排污权交易、命令和控制措施等。

　　庇古税是以防止企业对环境造成损害为目的的最为流行的对策，由剑桥学派代表经济学家庇古提出。简单来说，即污染税，通过征收税、费将环境代价转化为企业的内部成本，既可以是对污染直接征税，也可以是对减少污染的行为进行补贴。可交易的排污权可以由政府发给厂商，厂商间可以一定价格交易，政府也可以通过拍卖出售。命令和控制措施是政府直接管制污染的做法，可以设立工厂的排放标准，也可以要求工厂达到某种技术标准。

　　目前，我国所实施的环保措施以命令和控制为主，收取各种费、税为辅。这些税收措施零散地存在于资源税、消费税、增值税、耕地占用税等有关规定中，费用收取则更为地方化，我国还没有真正意义上的环境税。现在关于环境税的立法也正在积极的讨论之中。

　　庇古税看似简单的做法，却使发达国家受益匪浅。 1976 年，德国制定了世界上第一部征收排污税的法律 —— 《向水源排放废水征税法》，而后美国、法国等国家纷纷效仿，其开征的税种也越来越多，噪音税、垃圾税、消费税甚至超额粪便税等应有尽有。同时，征收环境税的收效也越来越明显，许多发达国家由此实现了环境的根本好转。

　　然而，庇古税的主张遭遇了制度经济学家科斯的挑战，原因在于庇古税的设立有一个前提，就是政府可以完全将污染排放量正确度量，那么医药制造所产生的噪音、废气、废渣等等这些边际成本如何确定准确的价格？科斯认为，环境问题说到底是市场产权界定不清，因此要明晰产权，包括所有权、使用权和开发权，建立环境产权市场。有个简单的例子：加拿大一进入冬季，人们就舞锹抡铲，冒着严寒把自家门前人行道上的积雪清扫得干干净净。因为如果未及时把雪铲掉，致使他人在门前摔倒，就要负法律责任。这个逻辑就是：属于你产权范围内发生的所有事情你都有责任。

　　无论是庇古税还是科斯手段，都致力于确定合理的环境成本；区别在于为使环境问题的外部效应内部化，庇古税和科斯定理提供了两种不同的思路：前者完全依靠政府干预，后者完全依靠市场机制。